メーリングリストの皆様 (重複して受け取られた方におかれましては、ご容赦ください。) 産総研 生命情報科学研究センターの福田です。 昨日まで開催されていたISWC (International Semantic Web Conference) に おいてTim Berners Leeのキーノート講演を含め幅広くサイトされました"BioPAX" の国際シンポジウムが来週１１月１８日にお台場の産総研別館 バイオ-IT融合研究棟 で開催されます。 参加登録は１６日正午まで可能ですのでご興味のある方はぜひご参加ください。 参加申し込み： http://www.biopax.org/japan_symposium/ ＃同時通訳機材・お座席の用意がありますので事前登録をお願いいたします。 また、テクニカルなディスカッションをするためのワークショップを １６−１７日に同じ場所で開催いたします。 こちらのプログラムは http://www.biopax.org/japan/ をご参照ください。ワークショップ参加希望の方は末尾のBioPAX国際シンポジ ウム実行委員会窓口まで個別にメールでお問い合わせください。 =====ご案内=========================================================== このたび、パスウェイデータの標準フォーマットをＯＷＬで定義 しているBioPAXという国際グループの主要な研究者を中心とした シンポジウムを開催することとなりました。 「パスウェイ」とは細胞の機能を実現する分子メカニズムを書き 下した知識のことで、ヘテロな構成要素からなり強く（ネットワ ーク状に）構造化されている特徴があります。 クリス・サンダー博士（米Memorial Sloan-Kettering Cancer Center） によるキーノート・レクチャーや日米欧の代表的なパスウェイデー タベースの各開発者による招待講演がございます。また、日本国内 やシステムズ・バイオロジー・コミュニティーからの招待講演もご ざいますので、最新のパスウェイデータベースの世界的な動向をま とめてきくことのできる絶好の機会となります。 参加申し込み： http://www.biopax.org/japan_symposium/ ================================================== the 1st International BioPAX Symposium --- Biological pathways: communication and analysis --- パスウェイ・インフォマティクスの未来と可能性―新たな知識基盤の構築 主 催 ： 科学技術振興機構 バイオインフォマティクス推進センター 文科省科研費 特定領域研究「生命システム情報」総括班 U.S. Department of Energy 共 催 ： JSBi オントロジー研究会 独）産総研 生命情報科学研究センター 開催日 ： ２００５年１１月１８日 開催場所 ： 独）産業技術総合研究所 臨海副都心センター別館 バイオ・IT 融合研究棟 11 階 新交通ゆりかもめ テレコムセンター駅 下車徒歩 3 分 東京臨海高速鉄道 東京テレポート駅 下車徒歩 15 分 http://www.cbrc.jp/cbrc/map/index.ja.html 講演言語 ： 英語（同時通訳有り) 参加費 ： 無料 参加登録 ： お座席や通訳機材の準備がございますので下記URL から事前参加登録をお願いいたします。(１１月１６日正午まで) http://www.biopax.org/japan_symposium プログラム： 9:30~9:40 Welcome/Introduction 1)9:40~10:10 BioPAX overview and applications (tentative) Gary Bader, Michael Cary, MSKCC. 2)10:10~10:40 aMAZE: a multi-layer data model for biological processes. Christian Lemer Free University of Brussels 3)10:40~11:10 the PATIKA Ontology, Modeling Language and Exchange Facilities. Ugur Dogrusoz Bilkent University Break 11:10~11:20 4)11:20~11:50 Reactome - knowledgebase of biological processes Imre Vastrik EMBL-EBI 5)11:50~12:20 INOH database - pathway data and pathway Ontologies Ken I Fukuda CBRC, AIST Lunch break 12:20~13:30 13:30~14:30 Keynote lecture 60 min Chris Sander, Director of the Computational Biology Center, Memorial Sloan-Kettering Cancer Center 6)14:30~15:00 Millennium Pharmaceuticals Pathway Database project (tentative) Alan Ruttenberg Millennium Pharmaceuticals 7)15:00~15:30 Representation of entities, interactions and pathways in the Transpath database Frank Schacherer, Biobase Break 15:30~15:45 8)15:45~16:15 KEGG for integrating genomic and chemical information Susumu Goto Kyoto University 9)16:15~16:45 ARM Database for Interactive Metabolic Maps Masanori Arita Tokyo University 10)16:45~17:15 Pathway modeling and simulation on Petri net based formalization Hiroshi Matsuno Yamaguchi University Break 17:15~17:30 11)17:30~18:00 SBML and Pathways (tentative) Michael Hucka Caltech 12)18:00~18:30 The BioModels DB (tentative) Nicolas Le Novere, EBI 講演者一覧： Alan Ruttenberg, Millennium Pharmaceuticals (PARIS) Christian Lemer, Free University of Brussels (aMAZE) Chris Sander, Memorial Sloan-Kettering Cancer Center Emek Demir and Ugur Dogrusoz, Bilkent University (PATIKA) Frank Schacherer, Biobase (Transpath) Gary Bader and Michael Cary, Memorial Sloan-Kettering Cancer Center (cPath, Cytoscape) Hiroshi Matsuno, Yamaguchi University (Genome Object Net) Imre Vastrik, EMBL-EBI (Reactome) Ken I. Fukuda, AIST (INOH) Masanori Arita, Tokyo University (ARM) Michael Hucka, Caltech (SBML) Nicolas Le Novere, EBI (BioModels DB) Susumu Goto, Kyoto University (KEGG) ○実行委員 高木利久, 東京大学 福田賢一郎, 産総研 生命情報科学研究センター Chris Sander, Memorial Sloan-Kettering Cancer Center Gary Bader, Memorial Sloan-Kettering Cancer Center お問合せ ： BioPAX国際シンポジウム実行委員会 〒135-0064 東京都江東区青海2-42 産総研 生命情報科学研究センター Tel: 03-3599-8080 Fax: 03-3599-8081 e-Mail:pathway_symposium@m.aist.go.jp --------------------------------------------- Ken Ichiro Fukuda, Ph.D. Computational Biology Research Center (CBRC) National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST) AIST Tokyo Waterfront Bio-IT Research Bldg. 10F 2-42 Aomi, Koutou-ku, Tokyo 135-0064 JAPAN Phone: +81-3-3599-8049 FAX: +81-3-3599-8081 fukuda-cbrc@aist.go.jp / ken.i.fukuda@gmail.com / fukuda_cbrc@yahoo.co.jp - http://www.cbrc.jp/~fukuda/index.html - INOH Pathway Database Project - - Integrating Network Objects with Hierarchies - http://www.inoh.org